Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNPO2Q9UMS6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms