Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR2

DDX19B, ATP-dependent RNA helicase DDX19B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX19BQ9UMR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX19BQ9UMR2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms