Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PADI4Q9UM07 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PADI4Q9UM07 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PADI4Q9UM07 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PADI4Q9UM07 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PADI4Q9UM07 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PADI4Q9UM07 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PADI4Q9UM07 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PADI4Q9UM07 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PADI4Q9UM07 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms