Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC7AQ9ULT0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC7AQ9ULT0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC7AQ9ULT0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms