Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SHROOM4Q9ULL8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHROOM4Q9ULL8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHROOM4Q9ULL8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHROOM4Q9ULL8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHROOM4Q9ULL8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHROOM4Q9ULL8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHROOM4Q9ULL8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
SHROOM4Q9ULL8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM4Q9ULL8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHROOM4Q9ULL8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms