Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV3Q9UKW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV3Q9UKW4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms