Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms