Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms