Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf18Q9UK00 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms