Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCTN4Q9UJW0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms