Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD1Q9UIS9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms