Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGXB4Q9UGU5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms