Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ABCF2Q9UG63 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms