Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms