Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF1Q9UBU9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF1Q9UBU9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms