Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
REREQ9P2R6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
REREQ9P2R6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
REREQ9P2R6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms