Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP35Q9P2H5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP35Q9P2H5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
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