Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms