Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC88CQ9P219 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.3 ms