Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms