Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD2L1Q9P0L9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2L1Q9P0L9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms