Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC59Q9P031 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms