Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMCD1Q9NZU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMCD1Q9NZU5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMCD1Q9NZU5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMCD1Q9NZU5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMCD1Q9NZU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMCD1Q9NZU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMCD1Q9NZU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMCD1Q9NZU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMCD1Q9NZU5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms