Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBP1Q9NZI7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBP1Q9NZI7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBP1Q9NZI7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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