Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MIS18AQ9NYP9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MIS18AQ9NYP9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms