Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms