Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDND1Q9NY35 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND1Q9NY35 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms