Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms