Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM260Q9NX78 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM260Q9NX78 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms