Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
IRAK4Q9NWZ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRAK4Q9NWZ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRAK4Q9NWZ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRAK4Q9NWZ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRAK4Q9NWZ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRAK4Q9NWZ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRAK4Q9NWZ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRAK4Q9NWZ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms