Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDX18Q9NVP1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms