Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM30AQ9NV96 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms