Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PDS5BQ9NTI5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PDS5BQ9NTI5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms