Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARSBQ9NSD9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms