Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms