Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA4L2Q9NRX3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms