Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO8Q9NRD0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms