Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR8Q9NR97 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms