Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms