Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2CQ9NQX7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2CQ9NQX7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms