Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A4GALTQ9NPC4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms