Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX8Q9HC52 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms