Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP29Q9HBJ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms