Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIN28AQ9H9Z2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms