Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCAS3Q9H6U6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAS3Q9H6U6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms