Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM12Q9H4Q4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms