Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4BQ9H444 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4BQ9H444 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms