Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOBPQ9H2D6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms