Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms