Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD1Q9GZZ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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